虽然大多数人更熟悉 Windows 系统，但由于 Linux 系统的免费、开源、稳定，许多科学计算软件都是主要支持 Linux，而许多研究组的服务器和计算机集群也已 Linux 系统为主．所以本书使用 Linux 作为编译和运行环境．注意，我们只介绍 Linux 的终端（terminal）操作，不涉及任何图形界面（User Interface，UI）．
严格意义上，Linux 并非完整的操作系统，而只是一个系统内核（kernel）．用户往往使用的是 Linux 的发行版（distribution），比如 Ubuntu、Debian、Redhat、CentOS、Deepin、Fedora、Arch 等．除 Linux 系统内核外，这些来自开发者社区的发行版还拥有 GNU 工具、附加软件和软件包管理器，大部分也有美观的图形界面．但使用这些操作系统大同小异．如果把 Linux 系统内核比喻为发动机引擎，那么发行版就是可以上路的汽车．
本百科选用 Ubuntu 进行介绍．
如果你的电脑已经有了 Windows 系统，使用 Linux 命令行可以有以下几种方式：
其中前 4 种方案可以在使用 Windows 的同时使用 Linux 命令行（注意：使用虚拟机会占用较多硬件资源，可能导致电脑卡顿），而双系统方案一次启动只能进入一个系统．
在 Windows 下使用 Linux 的另一种方案就是远程连接到另一台装有 Linux 系统的电脑
使用终端对计算机进行操作，并不像大多数人想象的一样困难．
一般来说，一条命令的构成是这样的：
命令的开头，我们输入命令的名称或者可运行的文件名．Linux 是大小写敏感的，即 cd 命令不能写成 CD．随后，我们附带上命令的选项及其参数，用空格加以区分．选项使用简称，一般加一个连字符-；选项使用全名，一般加两个连字符--（比如-h 和--help）．
当命令输入完成后，按 Enter 键，命令就会运行．初学者可以尝试输入 date，系统会输出日期．
暂时先列出最基础的命令行命令，请自行搜索学习
pwd 当前目录
ls 查看某目录的文件（-v 序号排序）
cd 改变当前目录
mkdir 创建目录（-p 创建多层）
rmdir 删除目录
cp 复制文件（夹）
mv 移动文件（夹）
touch 创建空文件或更改文件日期
rm 删除文件或文件（夹）
man，--help
echo 重复文字
>, < 和 “|”
cat 显示文本文件内容
vim 编辑文本文件
sudo 超级管理员权限
du，df 文件（夹）大小，硬盘容量
top 进程管理，资源占用
free 检查内存
tar，zip 压缩与解压
ln -s 符号链接（类似 windows 的快捷方式）
uname 系统信息
apt-get 安装软件
wget 通过 url 下载文件
chmod 修改文件权限
chown 修改文件所有者
hostname，hostname -I 本机名称，IP 地址
ping 检查是否可以连接到网络地址
reboot 重启
ssh 远程命令行．ssh-keygen，ssh-copy-id
sftp 远程传文件
find 搜索文件或目录 -exec 对搜索结果执行命令
grep 搜索字符串或文件内容
locate 搜索计算机的文件
nohup 不挂起，即退出终端不会影响程序的运行
& 后台运行命令
Ctrl+R 可以搜索命令历史，再次按下 `Ctrl+R` 可以跳到上一个匹配命令，按回车运行，按左右键编辑
Ctrl+C 种植正在运行的程序
Ctrl+Z 后台运行正在运行的程序
sed
dd 硬盘读写，如创建随机文件，全 0 文件．
tree 显示文件结构
sha1sum，md5sum 等指纹
rsync（若文件中含有转义字符需要三个反斜杠 \\\）
sshfs 基于 ssh 的远程文件夹
split 切割文件
LVM
make
gcc
g++
1. ^ 注意只有 Windows 10 支持 WSL，现已有 WSL2，安装教程请参考微软官方文档 https://docs.microsoft.com/zh-cn/windows/wsl/install-win10