常用科研软件列表

                     

贡献者： addis

　　 这里维护一份软件和程序包列表

1. 通用软件（不太属于本文）

• Chrome
• Firefox
• Adobe Acrobat
• 万兴 pdf（Adobe Acrobat 的国产替代）
• OneNote
• 有道笔记

2. 远程工具

• Windows Remote Desktop
• TeamViewer
• 向日葵
• ToDesk
• Jump Desktop

3. 通用语言和平台

• Zotero
• Matlab
• Octave
• Python
• OriginLab
• Julia
• Mathematica
• Maple

4. 文件管理

• Git
• WinSCP
• Clonezilla
• FileSeek (Windows)
• 7-zip

5. 文献管理

• Zotero
• Mendeley

6. 程序平台与环境

• Anaconda
• MinGW
• CygWin
• Windows Subsystem for Linux (WSL)
• Visual Studio
• Visual Studio Code
• CLion
• VirtualBox
• VMware

7. Linux

• rufus
• putty/kitty
• MobaXterm
• Singularity/Docker

8. 编译调试工具

• GDB
• Make
• Cmake

9. 科研写作

• TeXlive
• TeXstudio

10. 画图

• Adobe Illustrator
• Blender
• InkScape
• AxGlyph
• AxMath

11. 软件

• Windows Sandbox
• ManicTime
• WindirStat / Disk Inventory X (Mac) / K4DirStat (Linux)/Disk Usage (Android)
• SharpKeys
• Microsoft Office
• WPS Office
• LibreOffice
• 有道词典
• MathStudio (iOS)
• SIMO (iOS)
• Pythonista (iOS)
• Good Reader (iOS)
• Vim
• Google Earth
• Google Maps

12. 程序包

• 参考 这里
• numpy (python)
• scipy (python)
• matplotlib (python)
• Boost (C++)
• BLAS (C & Fortran)
• LAPACK (C & Fortran)
• CLAPACK / LAPACK++
• Arpack / Arpack++ (Fortran & C++)
• Spectra (C++)
• PETc：Portable, Extensible Toolkit for Scientific Computation
• SLEPc：Scalable Library for Eigenvalue Problem Computations
• GNU Scientific Library
• Intel OneAPI：包括 intel C/C++/Fortran 编译器，MKL 等
• FFTW
• Arb 任意精度球计算
• SageMath (Python) 开源的 Mathematica 替代
• GMP 任意精度整数和分数
• MPFR 任意精度浮点数计算
• MPIR
• Eigen (C++)
• Armadillo (C++)
• matlab2cpp (Matlab/C++)
• NLopt（C/C++, Fortran, Matlab, Python, Julia 等）非线性优化
• CGAL（C++）Computational Geometry Algorithms Library
• DLib（C++）machine learning algorithms and tools

计算化学/量子化学

• 参考这里
• DFT 软件参考这里
• Octopus
• GAMESS
• PySCF
• Basis Exchange