鱼类养殖包括在鱼缸或池塘等围栏里养鱼，通常是为了获取食物。以上形式是水产养殖的主要形式，而其他方法可能属于海水养殖。将幼鱼释放到野外进行娱乐性捕鱼或补充物种的自然数量的设施通常被称为鱼类孵化场。在世界范围内，养鱼业生产的最重要的鱼类是鲤鱼、罗非鱼、鲑鱼和鲶鱼。[1]
市场对鱼和鱼蛋白的需求正在增加，导致野生渔业的普遍过度捕捞。中国提供了全球62%的养殖鱼。[2] 截至2016年，超过50%的海鲜是由水产养殖生产的。[3]
养殖食肉鱼，如鲑鱼，并不总是能减轻野生渔业的压力。食肉养殖鱼通常食用从野生饲料鱼中提取的鱼粉和鱼油。根据粮农组织记录，2008年全球养鱼收益总计3380万吨，价值约600亿美元。[4]
| Top 15 cultured fish species by weight in millions of tonnes, according to FAO statistics for 2013 [1] | |||
|---|---|---|---|
| Species | Environment | Tonnage (millions) | Value (US$, billion) |
| Grass carp | freshwater | 5.23 | 6.69 |
| Silver carp | freshwater | 4.59 | 6.13 |
| Common carp | freshwater | 3.76 | 5.19 |
| Nile tilapia | freshwater | 3.26 | 5.39 |
| Bighead carp | freshwater | 2.90 | 3.72 |
| Catla (Indian carp) | freshwater | 2.76 | 5.49 |
| Crucian carp | freshwater | 2.45 | 2.67 |
| Atlantic salmon | marine | 2.07 | 10.10 |
| Roho labeo | freshwater | 1.57 | 2.54 |
| Milkfish | freshwater | 0.94 | 1.71 |
| Rainbow trout | freshwater, brackish, marine | 0.88 | 3.80 |
| Wuchang bream | freshwater | 0.71 | 1.16 |
| Black carp | freshwater | 0.50 | 1.15 |
| Northern snakehead | freshwater | 0.48 | 0.59 |
| Amur catfish | freshwater | 0.41 | 0.55 |
水产养殖利用的是当地的光合作用产物(广泛的)或以外部食物供应为食的鱼类(密集的)。
鱼类生长受到可用食物的限制，通常浮游动物以浮游藻类或底栖动物为食，如甲壳动物和软体动物。罗非鱼可直接滤食浮游植物，从而提高的产量。通过用人工肥料混合物(如钾、磷、氮和微量元素)给池塘水施肥，可以增加池塘的光合产量。
另一个问题是藻华风险。当温度、营养供应和可用的阳光对藻类生长最有利时，藻类会以指数级的速度繁殖，最终耗尽水体营养，导致鱼类死亡。因为腐烂的藻类生物质遮挡了阳光，因此它们可以耗尽池塘水中的氧气，并且腐烂的藻类也可以通过有机和无机溶质(如铵离子)污染池水，这可能(并且经常)导致鱼类大量流失。
水产养殖的另一种选择是使用湿地系统，如西班牙拉帕尔马岛兽医商业渔场使用的系统。
为了挖掘池塘中所有可用的食物来源，水产养殖者选择在池塘生态系统中占据不同位置的鱼类物种，例如滤食藻类的鱼类(如罗非鱼)、进食底栖生物的鱼类(如鲤鱼或鲶鱼)和进食浮游动物的鱼类(各种鲤鱼)或进食沉水杂草的鱼类(如草鱼)。
尽管有这些限制，重要的养鱼业还是使用这些方法。在捷克共和国，每年有成千上万的天然和半天然池塘被用来捕捞鳟鱼和鲤鱼。特雷本附近的大型朗伯池塘建于1590年，至今仍在使用。
| Acidity | pH 6–9 |
| Arsenic | <440 µg/l |
| Alkalinity | >20 mg/l (as CaCO3) |
| Aluminum | <0.075 mg/l |
| Ammonia (non-ionized) | <O.O2mg/l |
| Cadmium | <0.0005 mg/l in soft water; <0.005 mg/L in hard water |
| Calcium | >5 mg/l |
| Carbon dioxide | <5–10 mg/l |
| Chloride | >4.0 mg/l |
| Chlorine | <0.003 mg/l |
| Copper | <0.0006 mg/l in soft water; <0.03 mg/l in hard water |
| Gas supersaturation | <100% total gas pressure (103% for salmonid eggs/fry) (102% for lake trout) |
| Hydrogen sulfide | <0.003 mg/l |
| Iron | <0.1 mg/l |
| Lead | <0.02 mg/l |
| Mercury | <0.0002 mg/l |
| Nitrate | <1.0 mg/l |
| Nitrite | <0.1 mg/l |
| Oxygen | 6 mg/l for coldwater fish 4 mg/l for warmwater fish |
| Selenium | <0.01 mg/l |
| Total dissolved solids | <200 mg/l |
| Total suspended solids | <80 NTU over ambient levels |
| Zinc | <0.005 mg/l |
在集约化水产养殖系统中，只要提供足够的氧气、淡水和食物，每单位面积的鱼产量就可以随意增加。由于需要足够的淡水，渔场需要一个庞大的水净化系统。实现这一要求的方法是将水培园艺和水处理结合起来，见下文。放在河里或海里的笼子不适用以上规则，因为这些笼子有足够的含氧水来补充鱼产量。一些环保主义者反对这种做法。
单位鱼重的投入成本高于大规模养殖，尤其是因为鱼饲料成本高。鱼饲料必须含有比牛饲料高得多的蛋白质(高达60%)，以及平衡的氨基酸组成。这些较高的蛋白质水平要求是水生动物需要较高的饲料效率的结果(更高的饲料转化率 [fcr]，即生产每千克动物所需饲料的千克数）。像鲑鱼这样的鱼的平均fcr 约为1.1 kg 饲料可生产1 kg 鲑鱼[6] 而2.5 kg 饲料只能生产1 kg 的鸡r肉。鱼不需要能量来保持体温，消除了饮食中提供保暖所需的一些碳水化合物和脂肪。然而，这种饲料转化率上的优势可能会被较低的土地成本和由于高水平的输入控制而获得的较高产量所抵消。
水的曝气是必不可少的，因为鱼需要足够的氧气来生长。曝气通过鼓泡、叶栅流或含水氧气实现的。 鲇鱼亚种 （Clarias spp.）可以呼吸大气空气，可以忍受比鳟鱼或鲑鱼高得多的污染物，这使得通风和水体净化变得不那么必要。 Clarias spp. 是特别适合密集生产的鱼类。在某些情况下 Clarias spp. 养殖场中，大约10%的水体体积都是由鱼类生物量组成。
鱼类养殖，特别是在高密度鱼类养殖时存在与畜牧业相似的寄生虫感染风险，如鱼虱、真菌(水霉 spp。)、肠道蛔虫(例如线虫或吸虫)、细菌(例如， 耶尔森氏菌属 spp。, 假单胞菌 spp。)和原生动物(如甲藻)等。然而，畜牧业是人类农业中一个规模更大、技术更成熟的领域，并且已经开发出更好的解决病原体问题的方案。集约化水产养殖必须提供足够的水质(氧气、氨、亚硝酸盐等)以尽量降低对鱼类的压力。这一要求使得病原体问题的控制更加困难。集约化水产养殖需要严格的监控和养鱼户的高水平专业知识。
所有生产参数都受到控制的高强度循环水产养殖系统（RAS）正被用于高价值物种的生产上。通过循环水，单位生产用水量很少。然而，这个过程需要很高的资本和运营成本。更高的成本结构意味着RAS仅适用于高价值产品，例如用于产卵的孵卵器、用于网围栏水产养殖作业的鱼种、鲟鱼生产、研究动物以及一些具有特殊的小众市场，例如活鱼买卖市场。[7][8]
虽然由于每单位重量鱼的收入更高，饲养观赏性冷水鱼类(金鱼或锦鲤)理论上利润更高，但直到21世纪观赏鱼的饲养才能成功进行。锦鲤危险病毒疾病发病率的增加，以及锦鲤的高价值，促使一些国家采取措封闭式的锦鲤繁殖和生长系统。如今，一些成功的商业化锦鲤集约化养殖设施正在英国、德国和以色列运营。
一些生产商已经调整了他们的集约化养殖系统，努力为消费者提供不携带潜伏病毒和疾病的鱼。
2016年，尼罗罗非鱼幼鱼被用一种可代替鱼油的含有干燥的裂殖壶菌（Schizochytrium）的饲料喂养。与常规食物喂养的对照组相比，前者显示出更高的体重增加和更好的食物转化率，而且前者肌肉中健康的ω-3脂肪酸含量更高。[9][10]
在密集型和粗放型的水产养殖方法中，使用了许多特定类型的渔场；每个类型的养鱼场都有其独特的设计和应用优势。
养鱼网箱放置在湖泊、海湾、池塘、河流或海洋中，以容纳和保护鱼，直到它们被捕获。[11] 当笼网箱在海里的时候，这种方法也被称为“离岸养殖”[12] 。网箱可以由各种各样的组件构成。鱼被放在网箱里，进行人工喂养，达到市场规模后收获。网箱养鱼的一些优点是可以使用多种类型的水(体河流、湖泊、采被水填满的石场等)。可以饲养许多种类的鱼，养并且鱼可以与竞技性钓鱼活动和其他用水方式共存。[11]
公海网箱养鱼也越来越受欢迎。考虑到疾病、偷猎、水质差等问题，一般来说，池塘系统被认为更易于网箱养鱼的启动和管理。此外，过去发生的网箱故障导致鱼类逃跑的事件引起了人们对在水坝或开放式网箱中养殖非本地鱼类活动的关切。2017年8月22日，在华盛顿州普吉特湾的一个商业渔场的网箱发生了大规模的故障，导致近30万尾大西洋鲑鱼在非本地水域被放生。该事件被认为有危及当地太平洋鲑鱼物种的风险。[13]
尽管近年来网箱行业在网箱建造方面取得了许多技术进步，但风暴造成的损坏和逃逸风险一直是人们关注的问题。[11]
半潜式海洋技术开始影响鱼类养殖的方式。 2018年，150万条鲑鱼正在挪威海岸的一号海洋农场进行为期一年的试验。 这项耗资3亿美元的半潜式项目是世界上第一个深海水产养殖项目，它包括由一系列钢制框架和网线制成的61米（200英尺）高、91米（300英尺）直径的围栏，设计用于在受保护的沿海水域比传统农场更好地分散废物，因此能够支持更高的鱼类养殖密度。[14]
铜合金网
近年来，铜合金已成为水产养殖中重要的网织材料。铜合金具有抗菌特性，也就是说，它们能消灭细菌、病毒、真菌、藻类和其他微生物。在海洋环境中，铜合金的抗菌/除藻特性可防止生物污染，生物污损可以简单地描述为微生物、植物、藻类、管虫、藤壶、软体动物和其他生物的不良积累、粘附和生长。[15]
铜合金网对有机体生长的抵抗力也为养殖鱼类的生长和繁衍提供了一个更清洁、更健康的环境。传统的网织材料需要定期和劳动密集型的清洁。铜网除了防污之外，在海洋环境中还具有很强的结构性能和耐腐蚀性能。
铜-锌黄铜合金在亚洲、南美洲和美国(夏威夷)的商业规模水产养殖作业中得到应用。另外两种铜合金（铜-镍和铜-硅）正在进行广泛的研究，包括演示和试验 。这些合金类型中的每一种都具有减少生物污垢、笼子废物、疾病和抗生素需求的内在能力，同时可以保持水循环和氧气需求。其他类型的铜合金也被考虑用于水产养殖作业的研究和开发。[来源请求]
在东南亚，传统的网箱养殖平台被称为科龙（ kelong）。[来源请求]
这类渔场用灌溉沟渠或农场池塘养鱼。其基本要求是要有一条沟渠或池塘来蓄水，可能还要有地上灌溉系统(许多灌溉系统使用带集管的埋管)
使用这种方法，可以在通常衬有膨润土的池塘或沟渠中储存水的分配。在小型养殖系统中，鱼通常被喂以商业鱼食，它们的废物可以帮助农田施肥。在较大的池塘中，池塘种植水生植物和藻类作为鱼食。一些最成功的池塘种植引进的植物品种，以及引进的鱼类品种。
灌溉沟渠或池塘系统中水质控制至关重要。只要防止富营养化和保持高水平的氧含量，并对水体进行施肥、澄清和酸碱度控制就可以大大提高产量。如果鱼因电解质压力而生病，产量可能会很低。
复合鱼类养殖
复合鱼类养殖系统是印度农业研究委员会在20世纪70年代开发的一项技术。在这个系统中，无论是本地还是进口的鱼种，一个鱼塘中有五种或六种鱼的组合。由于这些物种拥有不同类型的食物栖息地，因此选择它们可以避免相互间的食物竞争。[16][17] 因此，池塘所有地方的食物都被利用了。在这个系统中使用的鱼包括鲶鱼和鲢鱼，它们是表层进食者，南亚野鲮鱼（rohu)，一个柱式进食者印度鲮 （mrigal）和普通鲤鱼，它们是底层进食者。其他鱼也以普通鲤鱼的排泄物为食，这有助于提高该系统的效率，该系统每年每公顷可产出3000-6000公斤鱼。
这种复合鱼类养殖的一个问题是，许多这种鱼类只在季风期间繁殖。即使鱼种是从野外采集的，它们也可以和其他物种杂交。因此，该养鱼系统的一个主要问题是缺乏高质量的鱼苗。为了克服这个问题，现在已经找到了用激素刺激在池塘里繁殖这些鱼的方法。这确保了所需数量的纯种鱼类的供应。
淡水养鱼最大的问题之一是每年每英亩能消耗一百万加仑水(每平方米约1立方米水)。扩展的水净化系统使本地水进行再利用(再循环)。
最大规模的纯养鱼场使用了一个源自20世纪70年代新炼金术研究所的系统(公认的是非常完善的)。该系统基本上是将大型塑料鱼缸放在温室里。水培床放置在鱼缸的附近、上方或中间。当罗非鱼在鱼缸中饲养时，它们能够吃藻类，藻类在鱼缸适当施肥后会自然生长。[来源请求]
池水缓慢地循环到水培床上，罗非鱼排泄物为商业作物提供养分。在水培床中精心培养的微生物将氨转化为硝酸盐，植物获取硝酸盐和磷酸盐的肥力。其他废物通过水培介质滤出，水培介质的兼作一个充气的卵石床过滤器。[来源请求]
这个系统经过适当调整，每单位面积产生的可食用蛋白质比其他任何系统都多。各种各样的植物可以在水培床中很好地生长。大多数种植者热衷于草本植物(如欧芹和罗勒)的种植，这些草本植物在全年的销售过程中都有是具有少量高价的特性。这些植物最常见的顾客是餐馆批发商。[来源请求]
由于综合循环系统建在温室中，它可以适应几乎所有温带气候，也可以适应热带气候。主要的环境影响是必须加盐才能维持鱼类电解质平衡的水的排放。目前的种植者使用各种专有技术来保持鱼类健康，减少他们的盐和废水排放许可费用。一些兽医权威推测紫外线臭氧消毒系统(广泛用于观赏鱼)可能在循环水保持罗非鱼健康方面发挥重要作用。
许多大型资本雄厚的企业都在综合循环养殖系统的领域丢掉了市场。生物学和市场的管理都很复杂。正如瑞典的“绿色鱼类倡议”行动所尝试的那样，鱼类养殖的一个未来发展方向是将综合循环系统与城市农业相结合。[18][19]
这也被称为“流通系统” [20] 鳟鱼和其他猎用鱼通常从鱼卵培育成鱼苗或鱼种，然后用卡车运至溪流中释放。通常，鱼苗是在长而浅的混凝土槽中饲养的，用新鲜的溪水饲养。鱼苗被饲喂颗粒状的商业鱼食。虽然不如上述新炼金术士的方法有效，但这种也简单得多，并且多年来被用于储备猎用鱼。 欧洲鳗鱼(安圭拉鳗鲡，Anguilla anguilla)水产养殖者为他们的农场从马尾藻海的繁殖地采购数量有限的玻璃鳗鱼，这是向北游动的欧洲鳗鱼的幼体阶段)。由于西班牙渔民过度捕捞玻璃鳗鱼和过度捕捞成年鳗鱼，欧洲鳗鱼面临灭绝的威胁，例如在荷兰的荷兰艾瑟尔湖。虽然欧洲鳗鱼幼体可以存活数周，但其整个生命周期尚未在圈养条件下实现。
养鱼业的饲料问题一直是一个有争议的问题。许多养殖鱼类(罗非鱼、鲤鱼、鲶鱼等)的饮食中不需要肉或鱼制品。顶级食肉动物(大多数是鲑鱼)依赖于鱼饲料，这类鱼饲料中的一部分通常来自野生鱼(凤尾鱼、鲱鱼等)。)中。植物来源的蛋白质已经成功地取代了食肉鱼类饲料中的鱼粉，但是植物来源的油还没有成功地被纳入食肉动物的饮食中。正在进行的研究试图改变这种情况，研究期望让鲑鱼和其他食肉动物也可以成功地用蔬菜产品喂养。正如一份由Wired 在2017年2月发布的一份报告中所说的那样：F3挑战(无鱼饲料挑战)，[21] ，“是一场销售10万公吨无鱼肉添加的鱼食的竞赛。本月早些时候，来自巴基斯坦、中国和比利时等地的初创企业在山景城(加利福尼亚州)谷歌总部参加了他们在美国竞争，展示了由海藻提取物、酵母和生物反应器中生长的藻类制成的饲料。”[22] 如同在挪威的发生的事件一样，不仅食肉鱼（例如i某些鲑鱼品种）的饲料的使用仍然有争议，因为这些饲料含有捕获的野生鱼的蛋白质，如凤尾鱼的蛋白质，但它们对鱼的健康没有帮助。2003年至2007年间，奥尔德林等人在挪威鲑鱼养殖场对三种传染疾病进行了研究—心脏和骨骼肌炎症、胰腺疾病和传染性鲑鱼贫血。症[23] 2014年，马丁内斯-卢比奥等人进行了一项关于心肌病综合征（CMS）的研究，这是一种大西洋鲑鱼(Salmo salar)的严重心脏病，研究了具有降低脂质含量和增加二十碳五烯酸水平的功能性饲料在鲑鱼感染鱼类心肌炎病毒(PMCV)后控制CMS的效果。功能性饲料被定义为高质量的饲料，除了营养的目的之外，它们还具有有益于支持疾病抵抗的健康促进特性，例如CMS。在选择使用功能性饲料的临床营养方法时，可能会放弃化疗和抗生素治疗，这可能会降低渔场疾病治疗和管理的成本。在这项研究中，提供了三种基于鱼粉的饮食——一种由31%的脂质制成，另两种由18%的脂质制成(一种含有鱼粉，另一种含有磷虾粉)。结果表明，当鱼感染PMCV病毒时，心脏组织中的免疫和炎症反应以及病理学有显著差异。用低脂功能性饲料喂养的鱼表现出较温和和延迟的炎症反应，因此，在PMCV感染后的早期和后期，心脏损伤不太严重。[24]
人工养殖过程中面临的第二个问题是，养殖鱼的密度是野生环境中不存在的(例如，在2英亩（8100平方米）的区域内有50，000条鱼 [25])中。然而，鱼也往往是以高密度聚集成大型鱼群的动物。最成功的水产养殖物种是群集物种，它们在高密度下没有社会问题。水产养殖者认为，如果饲养系统超过其设计能力或超过鱼类的社会密度极限，将导致增长率下降和饲料转化率增加(生产每公斤渔所需要的干饲料的公斤数)，这将导致成本增加和健康问题风险增加，同时利润下降。给动物施加压力是不可取的，但是必须从动物的角度，用科学方法来看待压力的概念和测量。[26]
尤其是海虱 （鲑疮痂鱼虱 ，Lepeophtheirus salmonis ）和各种各样的鱼虱（Caligus ），包括 C. clemensi 和 C. rogercresseyi 会导致渔场养殖和野生鲑鱼受到致命侵扰。[27][28] 海虱是一种体外寄生虫，以粘液、血液和皮肤为食，在自由游动的浮游生物中迁移并持续几天附着在无节幼体 和 桡足类幼体 幼虫阶段的野生鲑鱼皮肤上。[29][30][31] 大量的高度密集的开放式鲑鱼养殖场会产生异常高浓度的海虱；许多幼小的野生鲑鱼因暴露在包含大量开放式网状农场的河口而受到感染，因此无法存活。[32][33] 成年鲑鱼可能存活于数量极其有限的海虱中，但是迁移到海里的小而薄皮的幼年鲑鱼非常易于感染寄生虫。在加拿大的太平洋海岸，一些地区由海虱引起的粉红色鲑鱼死亡率通常超过80%。[34]
2008年对现有数据的meta分析显示，鲑鱼养殖降低了相关野生鲑鱼种群的存活率。这种关系已被证明适用于大西洋鲑鱼、钢头鲑鱼、粉红鲑鱼、马苏大马哈鱼和银鲑鱼。这些鱼类的存活率或丰度的下降通常超过50%。[35]
疾病和寄生虫是鱼类存活率下降的最常见原因。一些种类的海虱以养殖的银鲑鱼和大西洋鲑鱼为目标。[36] 这种寄生虫已被证明对附近的野生鱼类有影响。吸引国际媒体关注的一个地方是不列颠哥伦比亚省的布劳顿群岛。在那里，幼年野生鲑鱼在出海前必须“挑战”位于河口湾附近的大型渔场。据称，这些养殖场造成了严重的海虱感染状况，一项研究预测，到2011年，野生鲑鱼数量将减少99%。[37] 然而，这一说法遭到了许多科学家的批评，他们质疑鱼类养殖的增加和野生鲑鱼中海虱感染的增加之间的相关性。[38]
由于寄生虫问题，一些水产养殖经营者经常使用强力抗生素来维持鱼类的生存，但许多鱼类仍然过早死亡，死亡率高达30%。[39] 此外，北美和欧洲鲑鱼养殖场使用的其他常用药物包括麻醉剂、化疗剂和驱肠虫剂。[40] 在某些情况下，这些药物已经进入环境。[41] 此外，这些药物在人类食品中的残留也引起了争议。在食品生产中使用抗生素被认为会增加人类疾病中抗生素耐药性的流行。[42] 在一些养殖设施中，由于接种疫苗和其他技术，水产养殖中抗生素药物的使用大幅减少。[43] 然而，大多数养鱼作业仍然使用抗生素，其中许多抗生素会进入到周围环境中。[44]
1990年代的海虱子和病原体问题促进了目前治疗海虱和病原体的方法的发展从而这减少了寄生虫/病原体问带来的的压力。然而，在海洋环境中病原体物从野生鱼类向水产养殖鱼类的转移是一个持续存在的风险。[45]
大量鱼类长期保存在一个地方，导致附近地区的生境遭到破坏。[46] 高密度的鱼类的高浓度产生大量浓缩粪便，通常被药物会污染，这再次影响到当环境地的水道。
水产养殖不仅影响渔场里的鱼，还涉及到与其他物种的环境互动，而这些物种反过来又被渔场吸引或排斥。[47] 移动性动物 ，如甲壳动物、鱼类、鸟类和海洋哺乳动物，与水产养殖过程相互作用，但这些相互作用的长期或生态影响仍然未知。这些动物中的一些可能被吸引或表现出排斥。[47] 这种吸引/排斥机制在个体和种群水平上对野生生物有各种直接和间接的影响。野生生物与水产养殖的相互作用可能会对渔场的结构和组织方式相关的渔业物种和生态系统的管理产生影响。[47]
然而，如果渔场被正确地安置在一个强水流的区域，污染物会很快被冲走。这不仅有助于解决污染问题，流速更强的水也有助于鱼类的整体生长。 但人们仍然担心由此产生的细菌生长会带走水中的氧气，减少或杀死当地的海洋生物。一旦一个地区受到如此严重的污染，渔场就被转移到新的、未被污染的地区。这种做法已经激怒了渔场附近的渔民。[48]
水产养殖者面临的其他潜在问题是获得各种许可证和用水权、盈利能力、对入侵物种和基因工程的关切(取决于所涉及的物种)以及与《联合国海洋法公约》的互动。
关于养殖转基因鲑鱼，人们对其已被证实的繁殖优势以及如果释放到野外，转基因鲑鱼可能如何毁灭当地鱼类种群表示担忧。生物学家里克·霍华德 [49] 进行了一项实验室控制研究，允许野生鱼和转基因鱼杂交。1989年，AquaBounty Technologies公司开发了Aqua Advantage鲑鱼。在水产养殖中培育这种转基因鱼的担忧和批评是，这种鱼会逃脱并与其他鱼相互作用，最终导致转基因鱼与其他鱼的杂交。然而，美国食品和药物管理局已经确定，虽然网围栏不是防止鲑鱼逃跑的最合适方法，但在巴拿马水域饲养鲑鱼将有效防止逃跑，因为在鲑鱼逃跑的情况下，那里的水体环境将无法支持它们的长期生存。[50] 美国食品和药物管理局建议的另一种防止 Aqua Advantage 鲑鱼逃脱的方法是创造不育的三倍体雌性。这样一来，人们就不必担心Aqua Advantage 鲑鱼与其他鱼类一起繁殖了。[50] 转基因鱼排挤产卵场的野生鱼，但是后代存活的可能性更小。人们利用着色剂用来使圈养鲑鱼看起来像野生鱼一样红润，这与人类的视网膜问题有关。[48]
2005年，阿拉斯加通过立法，要求在该州出售的任何转基因鱼都要贴上标签。[51] 2006年，a 消费者报告 调查显示渔场饲养的鲑鱼经常被当作野生鲑鱼出售。[52]
2008年，美国国家有机标准委员会允许将养殖鱼类贴上有机鱼的标签，前提是其饲料中只有不到25%的成分来自野生鱼类。这一决定被“食品和水观察”倡导组织批评，称该决定“违反了关于有机标签的规则”。[53] 在欧洲联盟，自2002年以来，一直要求对鱼类贴上标签，进行物种、生产方法和产地的公示。[54]
人们对鲑鱼被贴上养殖或野生的标签，以及对人工养殖鱼的人道待遇仍然感到担忧。海洋管理委员会认证（MSC）已经建立了一个生态标签来区分养殖的和野生的鲑鱼，[55] 而皇家食品药品监督管理局（RSPCA）则设立了自由食品标签，以表明对养殖鲑鱼以及其他食品的人道待遇。[54]
室外开放式海洋网箱养殖的一种替代方法是使用循环水产养殖系统（RAS）。RAS是一系列培养罐和过滤器，水在其中被不断循环和监测，以保持全年最佳条件。为了防止水质恶化，通过去除颗粒物质对水进行机械处理，并进行将有害的积累化学物质转化为无毒化学物质的生物处理。
其他处理方法，如紫外线消毒、臭氧氧化化和氧气注入也可用于保持最佳水质。通过这个系统，水产养殖的许多环境缺陷被最小化，包括逃逸的鱼、水的使用和污染物的引入。这些做法还通过提供最佳水质来提高饲料使用效率。[56]
循环水产养殖系统的缺点之一是需要定期换水。然而，水交换的速率可以通过水耕来降低，例如加入水培植物[57] 和反硝化作用[58] 这两种方法都减少了水中硝酸盐的含量，并有可能消除水交换的需要，使水产养殖系统与环境隔绝。水产养殖系统和环境之间的相互作用量可以通过累积饲料负荷(CFB千克/M3)来衡量，该负荷衡量测量的是进入RAS的饲料量相对于排放的水和废物的量。
从2011年开始，由塔比特·乔杜里和戈登·格拉夫领导的滑铁卢大学团队研究了旨在生产富含蛋白质鱼类的垂直RAS水产养殖设计。[59][60] 然而，由于其高启动金和运营成本，RAS通常仅限于诸如亲鱼成熟、苗种培育、鱼种生产、研究型动物生产、无特定病原体动物生产以及鱼子酱和观赏鱼生产等实践生产中。因此，乔杜里和格拉夫的研究和设计工作仍然难以实施。虽然许多水产养殖者认为目前对其他物种使用RAS是不切实际的， 一些高价值产品如，美国的梭鱼、鲟鱼和活罗非鱼，[61][62][63][64][65] 荷兰的鳗鱼和鲶鱼和丹麦的鳟鱼成功应用了RAS系统，计划在苏格兰[66] 和加拿大的鲑鱼养殖中也应用RAS。[67]
充满二氧化碳的水箱被用来让鱼失去知觉。然后用刀子切开它们的鳃，这样鱼在被进一步加工之前就可以流血了。这种屠杀方法被认为是不人道的。电击或撞击击昏是诱发更少生理压力的方法，这些方法的应用使得欧洲逐步淘汰二氧化碳屠宰法。[68]
根据国家兽医研究所的T. Håstein 所说，“不同的鱼类屠宰方法已经到位，毫无疑问，从动物福利观点来看，其中许多方法可能被认为是令人震惊的。"[69] EFSA动物健康和福利科学小组2004年的一份报告解释说:“许多现有的商业捕杀方法使鱼类长期遭受巨大痛苦。现有的方法虽然能够以人道方式杀死鱼类，但在某些物种上却不能应用，因为操作者没有评估捕杀方式是否人道的知识。”[70] 以下是一些不太人道的杀鱼方法。
适当的击昏会使鱼立即失去知觉并持续足够长的时间，从而使鱼在屠宰过程中(例如通过放血)被杀死而不会恢复知觉。
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